由戴蘭達提倡、以基因決定人類命運的「命運計劃」瓦解後
為建立全新的和平秩序，以奧布聯合首長國代表卡嘉蓮為首，
正積極籌建世界和平監察機構「COMPS」。

C.E.74。大戰過後的世界，真一直無法找到自己該前進的道路。
就在此時，曾在過往戰場上奮戰的機動戰士，從札多移送至位於淤能碁呂島的COMPS臨時基地。
然而就在當晚，「突擊自由高達」竟遭不明人士強行奪走。

為了阻止事件擴大、奪回被搶走的機體，同時也為了保護必須守護的事物，
真等人再次投身於戰鬥之中——。